En sftp este comando carga recursivamente el contenido del directorio actual al directorio actual remoto:

put -r .

Ver man sftp .

Aunque no es estrictamente equivalente a sftp, rsync es una alternativa muy potente para scp y sftp, sobre todo a la hora de actualizar las copias de la máquina A a la máquina B, ya que no copia los ficheros que no han sido alterados; también es capaz de eliminar los ficheros de la máquina B que han sido borrados de la máquina A (sólo cuando se le indica, por supuesto).

En tu caso, la sintaxis sería

rsync -zrp /home/a/ user@remote.host.com:/home/b/

La opción -r es para copiar archivos recursivamente, -z permite la compresión durante la transferencia, y -p preserva los permisos de los archivos (creación de archivos, edición, etc.) al copiar, que es algo que scp no hace AFAIK. Hay muchas más opciones posibles; como siempre, lee las páginas de man.

scp (copia segura) es el método de facto de Linux para transferir archivos a través de un túnel seguro. En tu caso querrías usar el interruptor recursivo, por ejemplo

scp -r /home/a/ user@remote.host.com:/home/b/

Pruebe a utilizar

put -r /home/a/ /home/b/

para más información consulte: este

En realidad, put -r debería funcionar. Pero la carpeta de destino debe estar presente en su host remoto:

sftp> put -r sourcefolder
 Uploading sourcefolder/ to /user/folder
 Couldn't canonicalize: No such file or directory
 ....
sftp> mkdir sourcefolder
sftp> put -r sourcefolder
 Uploading sourcefolder/ to /user/folder/sourcefolder
 Entering sourcefolder/
 sourcefolder/file1
 sourcefolder/file2

En mi caso rsync no era posible así que usé

mput -rp /home/a/ /home/b/