Asegúrate de instalar el paquete Kernel Headers. http://www.cyberciti.biz/faq/howto-install-kernel-headers-package

Make sure you have updated version

Type the following command
$ sudo apt-get update

OR as root user enter:
# apt-get update

Search for kernel version (optional)

Type the following command:
$ apt-cache search linux-headers-$(uname -r)

Install linux-header package under Debina or Ubuntu Linux

Type the following command:
$ sudo apt-get install linux-headers-$(uname -r)

OR as root user:
# apt-get install linux-headers-$(uname -r)

EDIT:

Resulta que necesito instalarlo también en mi propio servidor y me dio el mismo error al intentar usar el virtualbox en los repos debian. Me adelanté y añadí el repo de VirtualBox e instalé desde allí. Esto es mejor porque están más actualizados.

Como root

$ nano /etc/apt/sources.list

Agregue la línea de abajo para squeeze

deb http://download.virtualbox.org/virtualbox/debian squeeze contrib non-free

Luego agregue la La clave pública de Oracle para apt-secure

$ wget -q http://download.virtualbox.org/virtualbox/debian/oracle_vbox.asc -O- | sudo apt-key add -

Luego ejecute update y para instalar la última 4. 2

apt-get update
apt-get install virtualbox-4.2

Instala el paquete dkms para asegurarte de que los módulos del kernel del host de VirtualBox están actualizados

apt-get install dkms

Debería estar todo listo. Conseguí estas instrucciones del sitio web de VirtualBox para Linux que parece estar caído en este momento pero el enlace es https://www.virtualbox.org/wiki/Linux_Downloads

Cómo arreglar esto para Fedora/CentOS

Primero asegúrese de que sus paquetes instalados (especialmente el kernel) están actualizados:

$ sudo yum update

Si actualiza la versión del kernel, tendrá que reiniciar para que uname -r coincida con el nombre del directorio en /usr/src/kernels/. Entonces

$ sudo yum install kernel-devel gcc
$ echo export KERN_DIR=/usr/src/kernels/`uname -r` >> ~/.bashrc
$ source ~/.bashrc # to set the variable in your current shell
$ sudo echo $KERN_DIR # verify the value is set
$ sudo ls $KERN_DIR # verify the directory exists

Después de esto compilar los módulos del kernel de VirtualBox debería funcionar sin problemas.

Fuentes:

• Ruta a la cabecera del kernel
• Cómo instalar Oracle VM VirtualBox en Fedora 20

Tuve el error KERN_DIR en CentOS. Revisé el script de instalación del shell, y encontré que establece KERN_DIR a /usr/src/kernels. Luego hice “uname -r” muestra que estaba ejecutando una versión inferior del kernel … que el código fuente bajo /usr/src/kernels.

Miré en /boot/grub/menu.lst … y confirmé el desajuste del kernel. Raro.

Así que la solución fue … “yum -y update kernel”, y luego reiniciar. Las herramientas de VMWare entonces se instalaron.

@hhh Debes buscar sólo linux-headers y encontrar el bueno para tu arquitectura. En mi caso:

# aptitude search linux-headers      
v linux-headers -                                                                              
p linux-headers-2.6-amd64 - Header files for Linux amd64 configuration (dummy package)                   
p linux-headers-3.2.0-4-all - All header files for Linux 3.2 (meta-package)                                
p linux-headers-3.2.0-4-all-amd64 - All header files for Linux 3.2 (meta-package)                                
i A linux-headers-3.2.0-4-amd64 - Header files for Linux 3.2.0-4-amd64                                         
i A linux-headers-3.2.0-4-common - Common header files for Linux 3.2.0-4                                        
p linux-headers-3.2.0-4-common-rt - Common header files for Linux 3.2.0-4-rt                                     
p linux-headers-3.2.0-4-rt-amd64 - Header files for Linux 3.2.0-4-rt-amd64                                      
i linux-headers-amd64 - Header files for Linux amd64 configuration (meta-package)                    
p linux-headers-rt-amd64 - Header files for Linux rt-amd64 configuration (meta-package)

Así que, en mi caso, tengo una arquitectura de 64 bits, tengo que instalar linux-headers-amd64.

Otra cosa es que apt-get add no existe. Sustituye apt-get por apt-key.

Pruebe:

yum install kernel* dkms gcc

Luego

yum install kernel-uek-devel

Luego reinicie su máquina

El error significa que vboxdrv/vboxadd no puede encontrar las fuentes del kernel.

El script espera que la carpeta /lib/modules/$(uname -r)/build apunte a /usr/src/kernels/$(uname -r) que debería tener el Makefile donde puede ejecutar la tarea kernelrelease, para que pueda comparar con su versión actual del kernel instalado (uname -r).

Así que si este comando falla:

make -C /usr/src/kernels/$(uname -r)/build kernelrelease

debe instalar las cabeceras de Linux por:

sudo apt-get install linux-headers-$(uname -r)

Para más detalles, por favor consulte este post .

En cualquier sistema operativo hay que asegurarse de que todos los paquetes necesarios están instalados. En mi caso en Debian me faltaban los paquetes dkms y linux-headers-generic.

#apt-get install dkms build-essential linux-headers-generic linux-headers-$(uname -r)

Para las instrucciones completas vea este post del foro de VirtualBox .