PPspliT, mencionado anteriormente, parece ser sólo para Windows.
Si estás en OS X, una opción (no siempre perfecta) que he utilizado es abrir el archivo PPT/PPTX en Keynote. En la barra de menú, seleccione “Archivo > Exportar a > PDF…” . A continuación, marque la casilla “Imprimir cada etapa de las construcciones”, y haga clic en “Siguiente…”. Advertencia: Al no ser su formato nativo, Keynote no siempre lee exactamente bien los archivos de PowerPoint. Comprueba que las diapositivas complejas (no sólo las animaciones, sino también las que contienen cosas como fórmulas matemáticas que requieren un formato preciso) se han reproducido fielmente. Si no es así, ajusta en Keynote para corregir cualquier aberración.
No he probado personalmente lo siguiente, pero para una solución entre sistemas operativos: Para LibreOffice (que también tiene importación de PPT/PPTX), existe esta extensión y esta . Tenga en cuenta, sin embargo, que esta última rasteriza todo a mapas de bits, lo que puede ser muy indeseable, dependiendo de su propósito.