Como señaló Graham, usar múltiples entradas de permisos para el mismo usuario (algo que nunca había probado antes) fue la clave aquí:
Los permisos de la carpeta padre dan a los usuarios casi libertad absoluta para hacer cualquier cambio… excepto que la casilla “borrar” está desmarcada - por lo que los usuarios no pueden borrar/mover/renombrar esta importante carpeta por accidente:
Pasando al segundo conjunto de permisos para el mismo usuario (que se aplican no a la carpeta en sí, sino a su contenido), vemos exactamente los mismos derechos concedidos al usuario, incluyendo privilegios de “borrado”.
Por lo tanto, los usuarios pueden hacer todo lo que deseen a las subcarpetas y archivos, incluyendo borrarlos/moverlos/renombrarlos.
Esta configuración me permite proteger las carpetas clave, como los directorios de exploración de destino personalizados que residen en las ubicaciones de red personales de los usuarios. Los usuarios pueden modificar el contenido (por ejemplo, eliminar los PDF de los escaneos que ya no desean conservar), pero no pueden causar problemas inadvertidamente al eliminar una carpeta que el escáner espera ver al guardar en la red.
Tuve que deshabilitar la herencia para la carpeta especial ya que de otra manera no era posible hacer cambios en los permisos del usuario que variaban de la raíz del recurso compartido de red; sin embargo, todas las _subcarpetas y objetos _utilizan la herencia para obtener sus permisos de su carpeta padre.
Una vez que he averiguado exactamente lo que había que hacer, sólo me ha costado un par de minutos ajustarlo para cada usuario. Ahora tengo la tranquilidad de que las carpetas clave de la red no pueden ser borradas accidentalmente por los usuarios.