Dado que está utilizando el Bloc de notas++, supongo que está utilizando Windows. Tienes algunas otras opciones para ordenar alfabéticamente el contenido de archivos de texto grandes.
Mi favorita es PowerShell. Puedes utilizar el cmdlet Sort-Object . El siguiente comando muestra un ejemplo de cómo utilizar el cmdlet. Primero leemos el contenido (Get-Content) de MiArchivo.txt, lo pasamos al cmdlet Sort-Object (Ordenar) y sacamos el resultado en un nuevo archivo (Out-File).
Get-Content MyFile.txt | Sort | Out-File MySortedFile.txt
Otra opción es utilizar el comando sort en el Command Prompt.
sort MyFile.txt /o MySortedFile.txt
Finalmente, la última opción es utilizar una herramienta online: miniwebtool.com o sortlines.com harán el trabajo.