Estoy asumiendo que originalmente formateó estas unidades en un sistema Intel Mac (OS X).
En lugar de parafrasear lo que he escuchado en otros lugares, simplemente citaré el artículo de Wikipedia para la partición del sistema EFI .
En los ordenadores Macintosh de arquitectura Apple-Intel, la partición EFI está inicialmente en blanco y no se utiliza para el arranque.
_Sin embargo, la partición EFI se utiliza como un área de preparación para las actualizaciones de firmware; en concreto, coloca una utilidad de flash de firmware (binario EFI) y un archivo de datos (FD - “Firmware Device”) en el directorio EFI/APPLE/FIRMWARE que luego se ejecuta al reiniciar el sistema en modo “flash firmware”. Si se borra, el sistema seguirá arrancando, y el gestor de arranque seguirá permitiendo a los usuarios elegir si quieren iniciar una partición Boot Camp o el Mac OS X por defecto, pero las actualizaciones de firmware fallarán.
Como creo que se ha señalado en otras respuestas, la partición EFI no es utilizada por Windows 7 y no se crea cuando se utiliza un sistema que no utiliza EFI. En otras palabras, si no vas a utilizar estas unidades como otra cosa que no sean unidades de datos entonces, sí, puedes eliminar la partición EFI.
Me temo que no me he tomado el tiempo de experimentar y averiguar si borrar la partición EFI resolverá los problemas que tienes con Windows 7 “viendo” tus particiones NTFS en la unidad. Pero parece que valdría la pena probar.
Si no recuerdo mal no podrás borrar la partición EFI desde la utilidad de Windows Disk Management. Una forma de eliminar la(s) partición(es) EFI es ejecutando DISKPART desde un símbolo del sistema (elevado) de Windows.
Yo lo hago seleccionando primero la partición que quiero borrar y luego verificando que he seleccionado la partición correcta. Abajo hay un ejemplo con uno de mis discos.
Después de estar seguro de haber seleccionado la partición que quieres borrar, el comando
delete part override
debería borrarla.
(Si no te importa ninguno de los datos de la unidad y sólo quieres reparticionarla, también puedes usar el comando clean. Para más información sobre él, escribe HELP CLEAN en DISKPART).
Espero que esto ayude.
DISKPART> list disk
Disk ### Status Size Free Dyn Gpt
-------- ------------- ------- ------- --- ---
Disk 0 Online 76 GB 0 B
Disk 1 Online 372 GB 32 GB
Disk 2 Online 465 GB 0 B
Disk 3 Online 931 GB 0 B
Disk 4 Online 149 GB 255 MB *
DISKPART> select disk 4
Disk 4 is now the selected disk.
DISKPART> list part
Partition ### Type Size Offset
------------- ---------------- ------- -------
Partition 1 System 200 MB 20 KB
Partition 2 Unknown 37 GB 200 MB
Partition 3 Unknown 111 GB 37 GB
DISKPART> select part 1
Partition 1 is now the selected partition.
DISKPART> detail part
Partition 1
Type : c12a7328-f81f-11d2-ba4b-00a0c93ec93b
Hidden : Yes
Required: No
Attrib : 0000000000000000
Offset in Bytes: 20480
Volume ### Ltr Label Fs Type Size Status Info
---------- --- ----------- ----- ---------- ------- --------- --------
* Volume 15 EFI FAT32 Partition 200 MB Healthy Hidden